Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLNP26678 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PLNP26678 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms