Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTSSP25774 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTSSP25774 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTSSP25774 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTSSP25774 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTSSP25774 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTSSP25774 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTSSP25774 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTSSP25774 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTSSP25774 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms