Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms