Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLP19338 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLP19338 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCLP19338 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCLP19338 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCLP19338 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCLP19338 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCLP19338 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCLP19338 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCLP19338 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLP19338 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLP19338 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLP19338 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLP19338 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLP19338 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLP19338 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLP19338 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLP19338 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLP19338 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLP19338 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLP19338 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLP19338 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLP19338 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLP19338 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLP19338 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLP19338 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLP19338 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms