Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIG1P18858 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
LIG1P18858 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIG1P18858 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIG1P18858 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIG1P18858 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIG1P18858 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIG1P18858 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIG1P18858 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms