Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL7RP16871 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL7RP16871 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL7RP16871 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL7RP16871 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL7RP16871 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL7RP16871 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL7RP16871 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL7RP16871 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL7RP16871 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL7RP16871 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL7RP16871 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL7RP16871 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL7RP16871 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
IL7RP16871 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL7RP16871 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL7RP16871 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms