Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB1P16220 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB1P16220 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB1P16220 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB1P16220 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB1P16220 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CREB1P16220 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB1P16220 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB1P16220 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB1P16220 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms