Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSP16219 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSP16219 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSP16219 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSP16219 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSP16219 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSP16219 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSP16219 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSP16219 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSP16219 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSP16219 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACADSP16219 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACADSP16219 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms