Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms