Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN1P12814 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN1P12814 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN1P12814 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN1P12814 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN1P12814 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN1P12814 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN1P12814 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms