Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms