Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLUP10909 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLUP10909 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLUP10909 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLUP10909 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLUP10909 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLUP10909 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms