Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD3P0DMS9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms