Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CT47B1P0C2W7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms