Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX3O75364 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms