Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms