Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms