Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRY3O43610 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms