Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF3O43395 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms