Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM6AO15550 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6AO15550 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms