Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF113AO15541 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms