Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms