Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms