Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F3O00716 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F3O00716 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F3O00716 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F3O00716 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F3O00716 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F3O00716 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F3O00716 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F3O00716 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F3O00716 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F3O00716 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F3O00716 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms