Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms