Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6BA6NDN3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms