Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6CA6NDK9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms