Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF222A6NCQ9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms