Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms