Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms