Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC144AA2RUR9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms