Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ6

KRTAP4-11, Keratin-associated protein 4-11, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-11Q9BYQ6 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF268-206ENST00000536899 3236 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 CX3CR1-206ENST00000542107 3215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAM111A-211ENST00000533703 4202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 CDH23-213ENST00000619887 4224 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC132825.3-201ENST00000562182 4710 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 TMCC1-201ENST00000393238 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 SOCS4-202ENST00000395472 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL590999.1-201ENST00000607675 3776 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 SNORA10-201ENST00000384084 133 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SL418P-201ENST00000473031 287 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL133351.5-201ENST00000612789 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 PRDM10-205ENST00000526082 3308 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ASPA-201ENST00000263080 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ARID1A-202ENST00000374152 6460 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 CNTN4-205ENST00000427331 4980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF322-207ENST00000607204 4737 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 AMPH-202ENST00000356264 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC6A2-206ENST00000567238 3160 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 DOCK11-202ENST00000276204 6664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 CORIN-208ENST00000508498 3200 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 THBS3-210ENST00000541576 3200 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 POU6F2-207ENST00000518318 5925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 EYA4-201ENST00000355167 5692 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 GSDMC-201ENST00000276708 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 HAL-203ENST00000541929 3846 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 IL2RB-201ENST00000216223 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 ITGB6-201ENST00000283249 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAM196A-202ENST00000522781 4403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 CXorf57-202ENST00000372548 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 UNC119-205ENST00000484980 4189 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 PLCH1-204ENST00000460012 6413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 CRX-201ENST00000221996 4470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 ATP6V1C1-201ENST00000395862 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 DHX9-201ENST00000367549 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 EMP1-201ENST00000256951 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 CDH18-201ENST00000274170 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAM171A1-201ENST00000378116 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC022784.6-204ENST00000520390 3442 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 AHNAK2-204ENST00000557457 3436 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 SYNE1-206ENST00000367253 5189 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 ACVR2A-207ENST00000535787 5166 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 ELP3-201ENST00000256398 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-11Q9BYQ6 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms