Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLF12Q9Y4X4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms