Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM2AQ9Y2K7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms