Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms