Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD4AQ9UPU9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD4AQ9UPU9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms