Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF18Q9UNG2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms