Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MED23Q9ULK4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED23Q9ULK4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms