Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms