Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNQ9P2M7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms