Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF12Q9NZN5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms