Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms