Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MS4A12Q9NXJ0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms