Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU23

LYRM2, LYR motif-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM2Q9NU23 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYRM2Q9NU23 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms