Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SALL1Q9NSC2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL1Q9NSC2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms