Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BIN3Q9NQY0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms