Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRDM10Q9NQV6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms