Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms