Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFGAP3Q9NP61 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms