Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms